關(guān)于蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的Ω環(huán)的介紹
Ω環(huán)(Ω loop)是近二三十年才發(fā)現(xiàn)的一類二級(jí)結(jié)構(gòu),它們雖然不像α螺旋和β折疊片那樣規(guī)正,但仍有規(guī)則可循,屬干部分規(guī)正的二級(jí)結(jié)構(gòu)。從形式上Ω環(huán)可看成是β轉(zhuǎn)角的延伸。此環(huán)有兩個(gè)特征。一是環(huán)的長度不超過16個(gè)氨基酸殘基,一般為6~8個(gè)殘基,尤以8殘基的Ω環(huán)為最多;二是它改變了蛋白質(zhì)肽鏈的走向,使得形成環(huán)的首尾兩個(gè)殘基之間的距離<1nm。
對(duì)肽鏈折疊成正確的蛋白質(zhì)構(gòu)象來說,規(guī)正的二級(jí)結(jié)構(gòu)一旦形成,就作為蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)的結(jié)構(gòu)元件存在,要把這些元件連接并組合成特定的三級(jí)結(jié)構(gòu)還有賴于像β轉(zhuǎn)角和Ω環(huán)這樣一些部分規(guī)正、但可變性較大的二級(jí)結(jié)構(gòu)。一般認(rèn)為蛋白質(zhì)中規(guī)正的一級(jí)結(jié)構(gòu)主要是維持三級(jí)結(jié)構(gòu)的輪廊直接跟蛋白質(zhì)生物活性有關(guān)、活動(dòng)性更大的部位絕大多數(shù)是由轉(zhuǎn)角和環(huán)構(gòu)成的。